讀音詞義不同
從字面來看，“藩籬”與“樊籬”的區別在于“藩”和“樊”：“藩”讀音是fān，“樊”的讀音fán；二者相同點是都有“籬笆”之意；不同點是“藩”還有“屏障”的意思，“樊”還有“關鳥獸的籠子”的意思。“藩籬”一詞在《辭海》（上海辭書出版社版本）中被釋為①用竹木編成的籬笆或圍柵。如《南史·韋傳》：“所至頓舍，修立館宇，藩籬墉壁，皆應準繩。”亦作“蕃籬”。賈誼《過秦論上》：“乃使蒙恬北筑長城而守藩籬。”此引申為屏障之義。庚信《哀江南賦序》：“江淮無涯岸之阻，亭壁無藩籬之固。”②比喻藝術境界。如蔡寬夫《詩話》：“王荊公晚年亦喜稱義山詩，以為知學老杜而得其藩籬，惟義山一人而已。”
“樊籬”在《現代漢語詞典》中解釋為：籬笆，比喻對事物的限制。如沖破舊禮教的樊籬。
對以上釋義有例句進行分析，我們可以得出這樣的詞義差別：“藩籬”是指具體的、感性的、形象的客觀存在的實物“籬笆”的門戶或屏障；“樊籬”是指概括的、理性的、抽象的主觀能動（一般多指思想、觀念方面）的虛物“籬笆”的限制和束縛。
感情色彩不同
“藩籬”一般情況下是中性詞；“樊籬”多用在反面語境中，故貶義色彩強烈些。