目的基因就是能夠產生所需蛋白質的DNA的片段，比如抗蟲棉就是植入能產生抗蟲蛋白的目的基因。
啟動子、終止子：啟動子、終止子是目的基因DNA上特殊排序的堿基。RNA從啟動子開始轉錄、翻譯，到終止子結束。整個過程完成后便產生所需蛋白質。
標記基因：用于檢測是否已經植入目的基因。植入的成功率其實很低，所以有必要選出已經植入的個體。比如抗蟲棉，判斷是否植入，用種植后讓蟲子吃的方法判斷周期太長。所以在目的基因前或后植入比如抗四環素基因（如果目的基因成功植入，抗四環素基因也一起植入），然后用四環素來淘汰植入失敗的個體，剩下的都是還有目的基因的個體。除了抗四環素基因，還有熒光基因等，總之就是方便檢測。